Dna Barkodlama Yönteminin Tarım Ve Tarımdışı Habitatlarda Zararlı Afit (Hemiptera: Aphididae) Türlerinin Tanımlanmasında Kullanılabilirliğinin Araştırılması


Kök Ş. (Yürütücü), Karanfil A., Korkmaz S., Kasap İ.

TÜBİTAK Projesi, 2023 - 2024

  • Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
  • Başlama Tarihi: Mart 2023
  • Bitiş Tarihi: Mart 2024

Proje Özeti

Afitler (Hemiptera: Aphididae) tarım alanlarındaki kültür bitkilerinin yanı sıra orman ağaçları, peyzaj ve kentsel alanlar gibi farklı habitatlarda bulunan bitkilerde bitki özsuyunu emerek zarar meydana getirmektedir. Bunun yanısıra afitler, ürettikleri tatlımsı madde salgısı nedeniyle fumajine sebep olur ve çok sayıda bitki virüs hastalığının da vektörlüğünü yapmaktadır. Afitlerin tür teşhisleri için üzerinde bulunduğu konukçu bitkiler temelinde gösterdiği morfolojik karakterlerden faydalanılarak oluşturulan konukçu bitki temelli teşhis anahtarları kullanılmaktadır. Afitlerin morfolojik karakterlere göre teşhisleri morfolojik plasitisiteye sahip olmaları ve doğru teşhis için mutlaka konukçu bitkinin de bilinmesinden dolayı oldukça zordur. Bu zorluklar düşünüldüğünde DNA barkodlama afitler için hızlı ve güvenilir tanımlama sonuçları sağlamaktadır. Yukarıda sunulan bilgiler ışığında, bu proje önerisi ile Kuzeybatı Türkiye’de yer alan Çanakkale ilinde tarım ve tarımdışı alanlardan 2017-2022 yılları arasında toplanan ve üzerinde bulunduğu konukçu bitkiler bilinmeyen veya teşhis edilemeyen afit türlerinin DNA barkodlama yöntemi kullanılarak hızlı ve güvenilir şekilde tür teşhislerinin yapılması amaçlanmaktadır. Ayrıca, afitlerin teşhislerinde DNA barkodlama yönteminin güvenilir sonuçlar ortaya koyup koymadığının da belirlenmesi amaçlanmaktadır. Bu amaç için, örneklerin DNA barkodlama yöntemi ile elde edilen sekans analiz verilerinin gen bankasındaki veriler ile karşılaştırılması sonucunda benzerlik oranı düşük ve genetik uzaklığı fazla olduğu belirlenen örnekler daha önceki toplandığı yıllara ait tarih, konum bilgileri ve teşhis edilemeyen konukçu bitkilerinin fotoğrafları kullanılarak 2023 bahar ve yaz aylarında aynı konukçu bitkiler üzerinden tekrar toplanacaktır. Böylece DNA barkodlama yönteminin sonuçları, afitlerin morfolojik teşhisleri ile karşılaştırılarak güvenilirliği konusunda veriler ortaya konacaktır. Sonuç olarak bu projede, tarım ve tarımdışı alanlardaki zararlı afit türlerinin teşhislerinde özellikle konukçu bitkinin tespit edilemediği durumlarda hızlı ve güvenilir tanımlama yöntemi olarak DNA barkodlamanın kullanmasının yanı sıra bu yöntemin güvenilirliğinin belirlenmesi amacıyla klasik morfolojik teşhis yöntemlerinin kullanması amaçlanmaktadır.