Akademik Veri Yönetim Sistemi
2. Ulusal HematoOnkoGenetik Kongresi / K.K.T.C., İskele, Kıbrıs (Kktc), 4 - 07 Mayıs 2023, ss.122
Giriş POLE geni DNA polimeraz epsilonun katalitik alt birimini kodlar. Enzimatik protein,
DNA onarımında ve replikasyonda işlev görür. AACR Projesi GENIE kohortunun verilerine
göre POLE, akciğer, kolon, endometrial adenokarsinomlar, kutanöz melanom ve meme invaziv
duktal karsinomu ile ilişkilendirilmiştir. Bu vaka serisinde POLE geninde varyant saptanan
hastaların verilerini sunarak literatüre katkı sağlamayı amaçladık. Yöntem Periferik kandan
DNA izolasyonu sonrası Yeni Nesil Dizi Analizi (NGS) yöntemiyle Ailesel kanser panelinde
bulunan 61 genin tüm ekzoonik bölgeleri ve ekzon-intron kavşakları çalışılmıştır. Sonuçlar
Qiagen Clinical Insight Interpret ile analiz edilmiştir ve Clinvar,Varsome,Franklin veri
tabanları da patojenite tayininde kullanılmıştır. Olgular POLE dışındaki genlerde
patojenik/muhtemel patojenik mutasyonu olmayan hastalar seçilmiştir. 12 hastada aşağıda
belirtilen “Klinik önemi bilinmeyen (VUS)” heterozigot varyantlar saptanmıştır. 1-Ailesinde
pankreas,akciğer,kolon kanseri, kendisinde endometriyum kanseri öyküsü olan 60 yaş kadın
hastada c.5608C>T;p.R1870C(NM_006231.4) 2-Ailesinde mide,meme kanseri öyküsü olan 43
yaş erkek hastada c.2090C>G(p.P697R)(NM_006231.4) 3-Ailesinde kolon,pankreas kanseri
öyküsü olan 38 yaş kadın hastada c.2747C>T;p.P916L(NM_006231.4) 4-Ailesinde
kolon,meme,akciğer öyküsü olan 26 yaş kadın hastada c.4957T>Gp.F1653V(NM_006231.4)
5-Ailesindede kolon,endometrium kanseri, liposarkom öyküsü olan 35 yaş erkek hastada
c.320C>A;p.A107E(NM_006231.4), c.3332G>A;p.R1111Q(NM_006231.4) 6-Meme duktal
karsinoma in situ tanılı 50 yaş erkek hastada c.2459T>C;p.M820T(NM_006231.4) 7-Meme
kanseri tanılı 49 yaş kadın hastada c.2018G>A;p.G673D(NM_006231.4) 8-Ailesinde meme,
pankreas, mesane, kolon kanseri öyküsü olan 55 yaş erkek hastada
c.3512T>A;p.L1171Q(NM_006231.4) 9-Ailesinde meme, mide kanseri öyküsü olan 48 yaş
kadın hastada c.431A>G;p.H144R(NM_006231.4) 10-Ailesinde akciğer kanseri öyküsü olan
21 yaş erkek hastada c.154C>T;p.R52W(NM_006231.4) 11-Meme kanseri tanılı 41 yaş kadın
hastada c.320C>A;p.A107E(NM_006231.4) 12-Ailesinde meme kanseri öyküsü olan 26 yaş
kadın hastada c.407A>T;p.K136I(NM_006231.4) Tartışma POLE gen mutasyonları OMIM
veri tabanında kolorektal kansere yatkınlık ile ilişkilendirilmesine rağmen; literatürde farklı
kanser tipi ile birlikteliği bildirilmiştir. Bizim hasta serimizde geniş bir kanser fenotipi yelpazesi
saptanmıştır. Hastalarımızda MLPA gibi delesyon, duplikasyon analizlerinin ve panel dışındaki
genlerdeki varyantları tespit edebilecek WES, CES gibi ileri analizlerin yapılmamış, bazı
hastalarda ailedeki primer kanser öyküsü olanların taranamamış olması, varyantların VUS
olması gibi sebepler ile POLE geni ile fenotip ilişkisi üzerine ileri çalışmalar yapılması yararlı
olacaktır. Daha büyük kohortlar ve farklı kanser türlerini içeren hasta serileri, POLE
mutasyonlarının kanser türleri ile arasındaki ilişkiyi açıklaması ve VUS varyantlarının
patojenitesini aydınlatmak için yararlı olacaktır.
Anahtar Kelimeler: POLE, NGS, kanser