HAM DERİLERDEN İZOLE EDİLEN ARKE İZOLATLARININ FİLOGENETİK OLARAK TANIMLANMASI VE EKSTRASELÜLER PROTEAZ AKTİVİTELERİNİN İNCELENMESİ
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2014
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Fevziye Işıl MEYDANİ
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): BİNNUR YAPICI
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada tuzla konservelenmiş ham derilerden izole edilmiş, fenotipik ve filogenetik olarak tanımlanmış iki farklı ekstrem halofilik arke izolatının ekstraselüler proteaz enzim kapasitelerinin ve optimum aktivite koşullarının belirlenmesi amaçlanmıştır. 16S rDNA dizi analizi sonuçlarına göre; 1 numaralı izolatın Halococcus morrhuae JCM 8876, 2 numaralı izolatın ise Natrinema pallidum 153 strainleri ile benzerlik gösterdikleri saptanmıştır. Nitel enzim aktivite bulguları pozitif olan strainlerin her ikisi de Gram negatif reaksiyon göstermiş olup Basitrasin ve Novobiosin antibiyotiklerine karşı duyarlı oldukları belirlenmiştir. Strainlerin nicel proteaz aktivitelerinin belirlenmesinde substrat olarak azokazein kullanılmış ve aktiviteler günlük olarak ölçülmüştür. Günlere bağlı proteaz aktivitelerinin belirlenmesinin ardından farklı sıcaklık (4-70 °C), tuz (1-5 M) ve pH (4,0-11,0) koşullarında optimum proteaz aktiviteleri tespit edilmeye çalışılmıştır. Halococcus morrhuae JCM 8876 ve Natrinema pallidum 153 strainlerinin günlük maksimum aktiviteleri sırasıyla 6. gün ve 4. gün olarak belirlenmiştir. Halococcus morrhuae JCM 8876 straininin pH 9,5, 2 M NaCl ve 50 °C, Natrinema pallidum 153 straininin ise pH 9,0, 2 M NaCl ve 40 °C reaksiyon koşullarında optimum aktivite gösterdiği tespit edilmiştir. Anahtar sözcükler: Tuzlanmış Ham Deri, Ekstrem Halofilik Arke, Ekstraselüler proteaz enzimi, 16S rDNA dizi analizi.