Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. Türünde Tuz Stresinin Gen Anlatımı Üzerindeki Etkisi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2010
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ÖZNUR TANRIVERDİ
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): CÜNEYT AKI
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada bir model organizma olan Arabidopsis thaliana (L.) Heynh bitkisinde sgf29a, ada2b-1, sgf29a;ada2b-1 mutantlarının tuza tolerans yanıtlarının anlaşılması ve gen ekspresyonlarındaki rollerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada öncelikle, T-DNA mutantı olan sgf29a, ada2b-1, çift mutant sgf29a;ada2b-1 tohumları kullanılmıştır. Kontrol olarak yabani form olan Wasilewskia (Ws) ekotipi kullanılmıştır. Çalışmada gen ifade analizleri için, in vitro bitkilere 100 mM NaCl uygulanmıştır. Tuz stresinin ardından, RNA izolasyon kiti kullanılarak sgf29a, ada2b ve sgf29a;ada2b-1 mutantlarından RNA ekstrakte edilmiştir. PCR reaksiyonları RD29B, RD22, COR47, COR78, COR6.6, COR15A, RAB18, GOLS3 ve XERICO spesifik primerleri kullanılarak uygulanmıştır. Böylece mutantlarda bu genlerin ifade oluşları Gelpro32 programı kullanılarak değerlendirilmiştir. Gen ekspresyon analizlerine ek olarak, 0mM, 50mM, 75mM, 100mM NaCl uygulamaları sonucunda mutant bitkilerin kök gelişimlerinin kontrol bitki ile karşılaştırılmaları gerçekleştirilmiştir. 4 gün boyunca kök uzamaları ImageJ programı ile ölçülmüş ve kayıt edilmiştir.Sonuçlar ada2b-1 mutantının tuz toleransına hassas olduğunu gösterirken, sgf29a bitkisinin yabani tip bitkiden dirençli olduğu gözlenmiştir. Kök gelişim analizlerinde çift mutant sgf29a;ada2b-1 tuz stresine ada2b-1 mutantından daha az hassasiyet göstermiştir.. Tuz yanıt genlerinin PCR sonuçlarına göre, COR15A, RAB18 ve RD29B gen ifadesinde ada2b-1 transkript seviyesinin yabanıl tip bitki ile karşılaştırıldığında azaldığı gözlenmiştir. Aksine XERICO gen ifadesinde ada2b-1 transkript seviyesi artmıştırAnahtar sözcükler: Arabidopsis thaliana, sgf29a, ada2b-1, gen ekspresyonu, SAGA kompleksi