Apomikt Boechera türlerinde CENH3 geninin karekterizasyonu

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2017

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: İREM KILIÇ

Danışman: Kemal Melih Taşkın

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu tezde, apomikt ve seksüel Boechera türlerinde CENH3 (sentromer spesifik H3 varyantı) gen yapısı ve gametofit ve tohum gelişimi sırasındaki anlatımı araştırılmıştır. CENH3 geni sentromere özgü bir histon varyantı kodlar. Bu protein hücre bölünmesi sırasında kromozomların ayrılmasında rol alır. Çalışmada, Boechera türlerine ait CENH3 gen dizileri nükleotid veri bankalarından elde edilmiştir. Bu diziler daha sonra, çeşitli biyoinformatik araçlar ile analiz edilmiş ve proteinin moleküler ağırlığı, 3D görüntüsü ve hücre lokalizasyonu belirlenmiştir. Daha sonra, CENH3 ile benzerlik gösteren diğer türlerdeki protein dizileri kullanılarak UPGMA ve Neighbour Joining yöntemleriyle filogenetik ağaç çizilmiştir. Ayrıca, dizilerden gene özgü primerler seçilmiştir. Çalışmada, CENH3 geninin Boechera türlerinde açmamış tomurcuk ve baklalarındaki anlatımları gerçek zamanlı (real-time) polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) tekniği ile incelenmiştir. Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonunda apomikt türlerde, CENH3 geninin mRNA anlatımının daha fazla olduğu gözlemlenmiştir.