DOĞAL APOMİKT ARABIS TÜRLERİNDEN FIS GENİNİN FERTILIZATION INDEPENDENT SEED) KARAKTERİZASYONU
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Mühendislik Fakültesi, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2007
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Sibel YILMAZ
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): KEMAL MELİH TAŞKIN
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada, triploid apomikt Boechera (Brassicaceae) türleri B. holboellii ve B. gunnisoniana'dan Arabidopsis thaliana FIS2 geni ortoloğu karakterize edilmiştir. Çalışmada, total RNA izolasyonu FIS2 genin ifade olduğu tahmin edilen çiçek ve bakla dokularından yapılmıştır. Boechera türlerine ait FIS2 gen ortoloğu A. thaliana'ya özgün primerler kullanılarak RT-PCR aracılığı ile çoğaltılmıştır. Bu primerlerden yaklaşık 2250 bç büyüklüğünde DNA bandı beklenmiştir. RT-PCR ürünleri %0,5'lik agaroz jel elektroforezi ile ayrılmış ve ethidium bromide ile boyandıktan sonra ilgili DNA bandı U.V altında görüntülenmiştir. Bu bant jelden izole edilmiş ve pJET1/blunt plazmit vektöre aktarılmıştır. Daha sonra pJET/blunt plazmit JM-109 ve JM-107 kompetent Escherichia coli hücre hatlarına transforme edilmiştir. Rekombinant koloniler, koloni PCR aracılığı ile tespit edilmiş ve bu kolonilerden plazmitler izole edilmiştir. Ardından rekombinant plazmitler restriksiyon endonükleazlar ile kesilerek beklenen büyüklükteki DNA bandını taşıdıkları doğrulanmıştır. Son olarak, çalışmada izole edilen PCR ürünlerinin dizi analizleri yapılmış ve AtFIS2 geni ile %83-87 oranında benzerlik gösterdiği bulunmuştur. Bu sonuçlar, triploid apomikt Boechera türlerinde FIS2 geni ortoloğunun mevcut olduğunu ve çiçek ve bakla oluşumu sırasında bu genin ifade edildiğini göstermiştir. Anahtar Kelimeler: FIS2, FIE, MEA, polycomb group proteinler, Arabidopsis thaliana, Boechera