TABAKLAMA ÖNCESİ İŞLEM BASAMAKLARINDAN BAZI ALKALİFİLİK MİKROORGANİZMALARIN İZOLASYONU VE MOLEKÜLER TEKNİKLERLE İDENTİFİKASYONU
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2014
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Derya DOĞANAY
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): BİNNUR YAPICI
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Çalışmada tabaklama öncesi işlem basamaklarından ıslatma-yumuşatma, kireçlik, kireç giderme-samadan proteaz, α-amilaz ve lipaz enzim aktivitesi gösteren alkalifilik bakterilerin izolasyonu, elde edilen izolatların fenotipik özelliklerinin belirlenmesi, fenotipik özelliklerine göre seçilen birbirinden farklı izolatların nicel enzim aktivitelerinin belirlenmesi ve moleküler tanımlamalarının yapılması amaçlanmıştır.Araştırma bulgularına göre söz konusu işlem basamaklarından 50 adet proteaz, 52 adet α-amilaz ve 15 adet lipaz aktivitesine sahip toplam 117 adet bakteri izole edilmiştir. Ancak lipaz aktivitesine sahip izolatların lipaz aktivitesi yerine esteraz aktivitesi gösterdikleri belirlenmiştir.İzolatların fenotipik özelliklerinin belirlenmesi için Gram boyama, bazı biyokimyasal testler, pH, NaCl ve sıcaklık tolerans testleri uygulanmıştır. Çalışmada fenotipik özellikleri belirlenmiş 117 izolatdan moleküler tanılama için birbirinden farklı 29 izolat seçilmiştir. Ayrıca bu izolatlardan nitel enzim aktivitesine göre yüksek aktiviteye sahip 12 adet proteolitik, 10 adet amilolitik toplam 22 adet izolat seçilerek nicel enzim aktiviteleri belirlenmiştir.Nicel enzim aktivitesi belirlenen proteolitik özellikteki 12 izolattan PS6 izolatının 4,40 ± 0,10 U/mL ve amilolitik özellikteki 10 izolattan AS6 izolatının 0,76 ± 0,01 U/mL' lik enzim aktivitesi ile diğer izolatlardan daha yüksek enzim aktivitesine sahip olduğu belirlenmiştir. Araştırmamızda 29 izolatın moleküler tanımlaması 16S rRNA dizi analizi ile yapılmıştır. Bu sonuçlara göre filogenetik olarak izolatların Bacillus subtilis, Bacillus pumilus, Bacillus altitudinis, Bacillus clausii, Bacillus cereus, Bacillus licheniformis, Bacillus majovensis, Bacillus sp. LCP66, Bacillus pseudofirmus, Bacillus polygoni, Bacillus clarkii, Bacillus sp. 2b-2, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus tequilensis, Uncultured organism clone ELU 0110, Bacillus thuringiensis ve Bacillus sp. LCP65 türlerine ait strainlere benzerlik gösterdiği tespit edilmiştir. Sonuç olarak araştırmamızda moleküler olarak tanımlanan 17 farklı Bacillus türünün 8'inin alkalifilik ve 9'unun ise alkalitolerant olduğu belirlenmiştir. Böylece deri proseslerinden daha önceden klasik ve moleküler yöntemlerle tanımlanan ve bilinen türler haricinde 11 yeni Bacillus türü bu çalışmada ilk kez tanımlanmıştır. Araştırma sonuçlarının bu konu kapsamında yürütülecek olan diğer araştırmalara ve hem ülkemiz hem de yurtdışındaki deri sektörüne oldukça önemli katkı sağlayacağı düşünülmektedir.